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Questo studio analizza dati di ricsequenziamento genomico su 639 accessioni di 48 specie di *Vitis* nordamericane, rivelando che l'introgressione diffusa (circa il 14% del genoma) e la variazione genetica condivisa guidano l'adattamento parallelo e la speciazione ibrida all'interno di questa radiazione adattativa.
Questo studio integra analisi dello sviluppo, ultrastrutturali e di connettoma per dimostrare che gli occhi cerebrali di *Malacoceros fuliginosus* sono occhi rhabdomerici invertiti con proiezioni neurali sovrapposte, supportando l'ipotesi che una duplicazione precoce di un occhio ancestrale abbia generato la diversità di coppie oculari osservata negli anellidi.
Lo studio dimostra che gli effetti di fitness dipendenti dalla frequenza sono la norma, piuttosto che l'eccezione, nelle popolazioni microbiche, alterando fondamentali le traiettorie evolutive anche in sistemi apparentemente semplici come l'esperimento LTEE di *Escherichia coli*.
Lo studio dimostra che l'assemblaggio alternativo dell'RNA contribuisce al dimorfismo sessuale negli insetti stick *Timema* e che la perdita della riproduzione sessuale porta a un'erosione sistematica di questa complessità di splicing.
Questo studio genomico rivela che il ctenoforo *Mnemiopsis leidyi* lungo la costa atlantica degli Stati Uniti comprende in realtà due specie distinte, *M. leidyi* e *M. gardeni*, che si sono separate durante le transizioni climatiche del Pleistocene e si sono adattate a diverse condizioni ambientali attraverso riarrangiamenti genomici e selezione naturale.
Il paper introduce wQFM-GDL, un metodo open source che estende il framework QFM per inferire alberi di specie su scala genomica partendo da famiglie geniche multi-copia, superando le limitazioni dei metodi esistenti in termini di accuratezza e scalabilità in presenza di duplicazione e perdita genica.
Lo studio rivela che gli spazzamenti selettivi morbidi, piuttosto che quelli rigidi, predominano nell'adattamento del vettore della febbre gialla *Aedes aegypti*, suggerendo una rapida capacità di risposta agli stress ambientali come gli insetticidi e identificando nuovi geni di resistenza.
Questo studio pionieristico utilizza il sequenziamento dell'RNA a singola cellula sui coelomociti del riccio di mare *Holothuria forskali* per rivelare la diversità trascrizionale di queste cellule immunitarie, identificando dieci cluster distinti (inclusi i progenitori e i carotenociti) e fornendo nuove intuizioni sulle loro funzioni immunitarie e sull'evoluzione delle linee cellulari nei deuterostomi.
Lo studio dimostra che l'evoluzione adattativa della Topoisomerasi II in *Drosophila simulans* impedisce la corretta risoluzione dello stress topologico indotto da specifiche sequenze satellite di DNA, causando l'incompatibilità genetica e l'isolamento riproduttivo con *D. melanogaster*.
Lo studio rivela che il ciliato *Paramecium sonneborni* ha superato le barriere di specie attraverso introgressioni genomiche ricorrenti da linee evolutive estremamente divergenti, un fenomeno reso possibile dalla separazione tra i nuclei somatici e germinale che permette l'eliminazione del DNA estraneo durante lo sviluppo, garantendo così la vitalità della prole ibrida.
Questo studio presenta la più antica evidenza di *Yersinia pestis* in Italia, risalente a circa 4950 anni fa, rivelando un caso di co-infezione con *Erysipelothrix rhusiopathiae* ed epatite B e fornendo nuovi dati sulla dinamica delle malattie zoonotiche nell'Europa preistorica.
Questo studio introduce il modello "covariomorph" in RevBayes per l'evoluzione dei caratteri morfologici, permettendo variazioni di tasso specifiche per lignaggio e carattere che migliorano significativamente l'accuratezza dell'inferenza filogenetica rispetto ai modelli tradizionali.
Questo studio dimostra che il salvataggio evolutivo in un sistema consumatore-risorsa dipende non solo dal tasso di crescita intrinseco, ma anche dall'effetto ecologico specifico del cambiamento ambientale, dalla storia vitale residente e dall'architettura genetica, rendendo insufficienti le sole misurazioni del tasso di crescita per prevedere la probabilità di persistenza.
Questo studio presenta la prima analisi su larga scala delle inserzioni di retrovirus endogeni non di riferimento in 163 topi domestici selvatici, rivelando una vasta diversità strutturale e dinamiche evolutive adattative, come dimostrato dalla diffusione del locus Fv4.
Questo studio dimostra che l'evoluzione della resistenza agli erbivori e della dimensione della rosetta in *Fragaria vesca* è fortemente dipendente dal contesto ambientale, poiché l'interazione tra selezione direzionale e covarianza genetica varia significativamente tra siti e condizioni di precipitazione, rendendo difficile prevedere le traiettorie evolutive future.
Questo studio integra dati genomici e trascrittomici per dimostrare come oscillazioni geoclimatiche e un'antica introgressione adattativa reciproca abbiano plasmato l'evoluzione e favorito la persistenza a lungo termine delle specie minacciate del complesso *Coilia* lungo le coste dell'Asia orientale.
Questo studio, attraverso l'analisi genomica comparata di *Stemona*, svela come la differenziazione metabolica degli acidi grassi tra elaiosoma e seme, mediata da specifici geni, faciliti la dispersione delle piante da parte delle vespe e ne spieghi l'evoluzione a partire da antenati dispersi dalle formiche.
Il paper introduce PEINT, un framework di deep learning che modella l'evoluzione delle proteine nel tempo catturando complesse interazioni tra siti e dinamiche di inserzione-delezione direttamente da sequenze non allineate, permettendo così di generare traiettorie evolutive realistiche e nuove proteine funzionali.
Questo studio propone e valida un modello di "hitchhiking pleiotropico" che, attraverso la selezione univariata sulla dimensione dell'ala, spiega l'allineamento osservato tra variazione mutazionale, genetica e divergenza evolutiva nelle ali della *Drosophila*, risolvendo il paradosso dei tassi di evoluzione senza invocare costi pleiotropici nascosti.
Questo studio dimostra che l'uso di dati genetici a singolo locus disponibili pubblicamente permette di analizzare i modelli globali di diversità filogenetica dei pipistrelli, rivelando come le variabili climatiche storiche e attuali, insieme a fattori geografici e demografici su scale diverse, guidino la distribuzione della biodiversità e informino le strategie di conservazione.